Hola, ct.
¿Te serviría algo parecido a esto?
Código PHP:
<html>
<head>
<script>
ancho=screen.width;
if (ancho<=800) hoja='uno';
else hoja='dos';
document.write("<link rel='stylesheet' href='"+hoja+".css' type='text/css'>");
</script>
</head>
<body>
Este texto se verá en color
</body>
</html>
Saludos,