Bueno de echo Microsoft pensó en algo parecido a lo que tú quieres y se llama Microsoft Windows Home Server este es un servidor hogareño el cual tú lo adaptas a tu requerimientos y lo que hace es sincronizar las carpetas que elijas, crear respaldos automáticos, monitorear los equipos, sus rendimiento, requerimientos, hasta te permite acceder desde internet a tus archivos en las computadoras que se encuentren agregadas y etc...
ELPROBLEMA:>>> Esta basado en Windows Server 2003, requiere una computadora solo y exclusivamente para él y la computadora de be estar todo el tiempo encendida...
SOLUCION:>>> Ya que instalar Windows Home Server no parece una opción yo creo que lo mejor es que uses este programa que lo puedes conseguir googleando el programa que se llama "
OneSync 2.0"
Espero haberte ayudado...