para eliminar contenido, normalmente se usa innerHTML. como dices que quieres eliminar EL contenido de la ventana padre has de usar window.opener. de tal modo que supongamos que en la ventana padre tienes un elemento con id "elem1" y, quieres borrar su contenido, entonces, has de hacer algo como esto
Cita: window.opener.document.getElementById('elem1').inn erHTML = '';