Saludos
Debes ir manejando un condicional y por cada item seleccionado, realizar la condición para construir la sentencia sql por ejemplo:
Código PHP:
$condicion="";
if($seleccion['ciudad']!=""){
$condicion.=" ***** ";
}
if($seleccion['escuela']!=""){
$condicion.=" ***** ";
}
if($seleccion['grado']!=""){
$condicion.=" ***** ";
}
......