¿Imagenes PNG transparentes ya no son un problema para los navegadores?

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Únicamente ie6 y anteriores no soportan las transparencias png. Desde la versión 7 de ie, MS da soporte a estas transparencias.

La solución para la 6, como dice abimael, es con js:

<!--[if lt IE 7.]>
<script defer type="text/javascript" src="pngfix.js"></script>
<![endif]-->

aunque también puedes solucionarlo con los filtros de MS, en css:

filter: progid:DXImageTransform.Microsoft.AlphaImageLoader (src="imagen.png");