Emm... pero eso no tiene nada que ver... se supone que el link lo estas enviando a la funcion confirmar().... o sea
Código HTML:
Ver original<a href="#" onclick="confirmar('eliminar.php?id=2')">Eliminar
</a>
Lo que hacemos ahi es que el href no sirva para nada y que el onclick sea el que trabaja...
Suerte!