Hola.
Hazle caso a GandiX, es muy importante formatear todo en limpio, tanto si tienes un virus como sino lo tienes, puesto que instalar una versión de Windows encima de otra da en ocasiones algunos problemillas.
Si haces eso el virus desaparecerá por completo y otra cosa muy importante asegúrate de que los diskettes que has estado usando hasta ahora estén bien formateados también antes de insertarlos una vez hayas instalado windows.
Saludos