Debes tener claras dos cosas:
1.- que javascript no se ejecuta del lado del servidor sino del cliente
2.- que php se ejecuta del lado del servidor y no del cliente
Ergo, lo que quieres hacer de pasarle datos de "javascript" a "php" es imposible hacer sin enviar un metodo ajax o cargar un formulario por get o post.
De esta manera puedes enviar cuantas variables necesites pero ya pasan de ser javascript sino mas bien variables POST o GET (en cualquiera de los dos casos)
Para tu caso en particular me imagino que puedes usar ajax, hacer la peticion a otra pagina php con el valor de javascript y tomar el contenido de esa pagina y devolverla como html a la funcion javascript que hace la peticion.
Suerte!
