Entonces de ser asín parece ser un problema directos de los puertos.
LA ultima opciones seria resetear la bios del sistema ya sea atraves de la pila CR2032 o atraves del jumper de la motherboard(CLEAR_CMOS), posteriormente carga los valores por defecto, y comprueba nuevamente los puertos.
Si persiste la inestabildiad actualiza la bios a la ultima versión existente por el fabricante de tu motherboard.
Si después de todo ello continua el problema, seria cuestión de integrar una controladora USB-PCI a la motherboard.