Lo mas fácil es usar variables de session en PHP.
El la pagina que tenes el hipervinculo, en la primer linea poné:
Código PHP:
<?php
session_star();
$_SESSION['popup'] = "algunvalor";
?>
En el popup:
Código PHP:
<input type="text" name="campo" vale="<?php echo $_SESSION['popup']; ?>">
Y con el mismo ejemplo, después recuperas el valor del campo del popup.