Buenas
 
Lo más fácil es que uses el método GET (que veo que ya lo usas para modificar y eliminar), pero podrías hacerlo de otras formas (sesiones, cookies...) 
Para hacerlo con GET, sólo tienes que cambiar esto en el código: 
 Código PHP:
    $result=mysql_query("select per_nom from personas where emp_cod=".addslashes(htmlspecialchars($_GET['id'])),$link);
// addslashes() es un control de seguridad para tus bases de datos
// htmlspecialchars() es un control de seguridad de código "malicioso" en HTML 
    
  Luego, en la otra página, donde llamas al enlace debes añadirle en el enlace 
?id= y la variable que contiene el código cogido por base de datos. Por ejemplo, supongamos que la página del popup se llama 
grid.php, pues accederás así: 
grid.php?id=356 o bien 
grid.php?id=123, etc. 
Saludos