lo mejor es dividir tu código como dice
abimaelrc, pero es valido poner el javascript dentro del contenido php sin ningun problema y decirle que lo tome como texto literal por medio de las comillas simples, ejemplo
Código PHP:
Ver originalecho '<script type=”text/javascript”>document.addEvent("domready", function() { $("a2").tooltip ("<h1>Title Formating</h1><p><? echo $n; ?></p>", { width: 200, style: "alert" }); });</script>';
sin embrago, debes de tomar en cuenta donde debes de colocarlo y que el php no procesará estos datos, los enviará al navegador tal cual y este se encargará de interpretarlo.
saludos.