seguridad ftp

[Filgood]

Hola. Estoy construyendo una aplicación de álbum fotográfico. Tenia pensado que cuando un usuario se crea una cuanta en la web, automáticamente mediante una función, se cree un directorio en el servidor web con el nombre del user, y así poder alojar en ese espacio las fotos de cada user por separado.
Mirando por la red, me he encontrado con la funcion ftp_mkdir() , pero he visto que hay que pasarle como argumentos, la url y los datos del ftp. Mi pregunta es la siguiente ¿ no se compromete así la seguridad del servior ftp ? ¿ hay alguna forma de encriptar dichos datos ? ando un poco perdido. Gracias