¿Te referís a IE6? IE7 soporta transparencia sin problemas.
Para IE6 he usado esto y funciona hermosamente:
http://jquery.andreaseberhard.de/pngFix/
Es fácil de aplicar, soporta PNG32 tanto como imagen <img> o como fondo. No soporta sprites (varias imagenes en una sola posicionadas con CSS).