La elección del CMS es puramente personal y dependerá en grado sumo de tu capacidad para resolver los inconvenientes que puedan presentarse. En algún caso dependerá también del tamaño de la comunidad que hay detrás de cada uno de ellos, y del tipo de soporte que obtengas.
De cara a los motores de búsquedas, no existe un CMS con mayores ventajas que otro. En especial atención a que los
crawlers leen el HTML generado y no el lenguaje del lado del servidor.
Por otro lado, califica además, el tipo de configuración post-instalación; esto es el agregado de plugins, por ejemplo o la configuración del .htaccess (si tu aplicación corre sobre Apache).
Y, finalmente, la optimización on-page que lleves a cabo. Esto no te lo da ningún CMS
per sé. Corre por cuenta y orden tuyo y el grado de conocimiento SEO al respecto.
