Mysqldump me hace el backup a medias y PHPMyAdmin también

[gnzsoloyo]

Puede que estés confundiendo la longitud del backup de la base, con el tamaño de la base en sí.
Jamás son iguales.
El motivo es simple: Ninguna de las dos herramientas mete los índices en un backup, lo que hace que la longitud del archivo generado sea siempre menor.
¿Por qué no los mete? Bueno, es simple:¿Para qué meter en el backup algo que de todos modos se va reconstruyendo sólo, a medida que los datos de las tablas, que sí están en el backup, se van cargando?
Poner los índices implicaría que luego de cargar nuevamente todo, habría que indicarle que haga un reindexado para eliminar basura... No tendría ninguna utilidad.