Cita: Pero la idea es que sera una tabla muy grande, por lo tanto la optimización es primordial
¿A qué le llamas "muy grande" en cuanto a tabla?
Cita: Y obtengo la ip y el timestamp para añadirlos al txt, pero me interesaría poner también el id que es autoicremen.
Para eso en PHP existe la función
mysql_insert_id().
Cita: Si utilizo LAST_INSERT_ID() seguidamente podría haber un cruce de datos.
¿Cruce de datos? ¿A qué te refieres?