Que tal
Nemutagk,
Zend_Validate_Alnum recae sobre Zend_Filter_Alnum, para la validación, lo mas prolijo seria que te crearas el par My_Validate_Custom - My_Filter_Custom y que este último agregara a la expresion regular los caracteres que necesitas(,.;), si tomas como template las clases de Zend, no deberias tener problemas para hacerlo.
Otra opción es utilizar el Validator
Callback, aunque lo anterior es para mi mejor solución.
Saludos.