No entendí bien lo que necestias, pero traté de acomodar un poco mejor el código que pones, espero eso ayude de algo...
   
Código PHP:
Ver original- $sql1 = "SELECT *  
-     FROM v_catarticulos  
-     WHERE id_partida = 16"; 
-          
- $sql2 = "SELECT id_entrada  
-     FROM ventradasalm  
-     WHERE id_partida = 16"; 
-                  
- $anterior = 0; 
- $contador = 0; 
-                
-     $id_entrada = $row_articulos['id_entrada']); 
-     $id_articulo = $row_articulos['id_articulo']); 
-   
-     $sql3 = "SELECT cantidad 
-         FROM afectacion_ent  
-         WHERE id_entrada = $id_entrada  
-         AND id_articulo = $id_articulo 
-         AND fecha_ent < '2011-02-28'"; 
-   
-     $contador ++; 
- }