Bueno eso ya depende de la calidad del material fuente. Pero lo suyo es comprimirla a un tamaño grande y con máxima calidad. También hay que considerar que cuanto más movimiento tenga la película más riesgo tienes de que pixele, es cuestión de ir probando con calma settings en el media encoder u otro, agregarle más fotogramas clave, etc.
Depende mucho de la película que tengas. La ventaja está en la descarga progresiva que permite aumentar el peso de la película (también hasta cierto punto creo yo).
dejo algunos links sobre el uso de media encoder y demás
http://www.adobe.com/es/devnet/flash...ide_print.html http://www.simplewebtv.com/es_tutori...ia_encoder_cs4 http://www.manualespdf.es/manual-ado...a-encoder-cs4/
saludos