Pues fijate que siempre si lo hice con htaccess.
Únicamente lo que hice fue poner esto dentro del archivo de: htaccess y listo!!
Options -Indexes
ahora cada vez que quieren teclear un archivo directamente en web, ya no les hace el listado del contenido de la carpeta, les marca error.
Así que ya quedó arreglado!!! Gracias!!!