¿Merece la pena separar codigo de diseño para pequeños proyectos?

[Axo]

Hola, a ver... no lo tengo todo "mezclado" actualmente esta estructurados por secciones y modulos. Pero no separado el código de programacion con el de diseño. Es decir, lo que pregunto es si me recomiendan separar el código html,css por un lado (tpl's) y el otro por otro lado diferente (php, select's..).

Son webs pequeñas que no creo que vayan a crecer mucho. Son pequeños catálogos y noticias... cómo mucho en un futoro querran un carrito de compra y poco más... y si creciera mucho, es cuando ya se podría separar por completo.