Hay varias opciones, al cargar el formulario que hace el update, hagas una consulta para que se llene el value de los inputs de este modo tendrias los valores de la tabla, si solo cambias uno el otro queda igual, la otra forma es usando condicionales com la anterior, si un input esta vacio, eu no se tome encuenta algo asi
Código PHP:
Ver originalif($_POST['campo1'] == "")
{
//consulta uno
}
else if()
//blablabla
tambien vale un switch case