lo solucione!!, quizas hay otras soluciones pero esta funciona. dejo el codigo por si alguien lo necesita, saludos.
Código PHP:
.
.
.
$img=1;
//listar imagenes en miniatura while($row=mysql_fetch_array($_pagi_result)){
echo"<a id=\"$img\" title=\"\" href=\"img/$imagen\"><img alt=\"\" src=\"img/$imagen\" width=\"45\" height=\"45\" alt=\"$imagen\"/></a>";?>
?>
//llamada a javascript
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function()
{
$('#<?php echo $img;?>').imgbox();
}
);
</script>
<?php
$img=$img+1;
}//cierro while
?>