En el 2011, usar innerHTML ó DOM ?

[marlanga]

También lo decía por la cantidad de elementos a modificar de golpe. Si son pocos, no sé, digamos menos de 20, entre usar DOM o innerHTML no habrá mucha diferencia. Mejor DOM, ya que es más autoexplicativo.
Sin embargo, a veces, yo he tenido que hacer scripts que modifican muchas celdas de tablas de 300 filasy 20 columnas, y no hay color: innerHTML por cojones.
Si recorriera el árbol DOM de la tabla se colaría un retardo que volvería incómoda la funcionalidad que buscaba.
Pero ya digo, depende del caso donde se vaya a aplicar.