Lo que debes hacer es configurar un servidor DNS y en el archivo donde se va a crear la configuracion de las zonas, especificas en una linea un nombre Canonico, osea un registro CNAME, el registro seria mas o menos asi;
donde dns.dominio.go.bo, es el nombre del servidor DNS y lo demas son los parametros de A = direccion y CNAME = canonical name ..
Ahora en el directorio sites-available debes crear un host virtual donde en el campo ServerName va el nombre del sitioX ..
Aaa y tambien debes agregar el nobre del SitioX en el archivo /etc/hosts asi;
Saludos .. !