Buenas
Pues yo soy tambien cliente de ellos (antes estuve en abansys y ni punto de comparación).
Tengo un magento y otro joomla en php5 y no tengo ningun problema con los permisos como comentas, cualquier archivo creado sea por FTP o por web lo puedo modificar por FTP, no sabria decirte si existe algun problema con los alojamientos en php4.
Luego, la propuesta que tienen esta a medida, con lo que evidentemente si quieres un alojamiento a tope de componentes, mejor buscarte un proveedor que te ofrezca todo en un plan (pero facilmente puedes subir a 4 o 5€ al mes). Pero vamos, no les veo caro por la configuración que tengo (eso si, la tengo ajustada solo a lo que necesito).
Un mes tuve una promoción en adwords de mi web, ese mes subi el trafico, al mes siguiente pude bajarlo, y eso para mi al menos es toda una ventaja.
En cuanto a los www delante de un subdominio, no se si se puede hacer o no con configbox, pero no le veo mucho sentido, un subdominio en el 99% de los casos es en formato
http://subdominio.dominio.com.
Finalmente, TE ATIENDEN, siempre uso el chat y enseguida te contesta alguien que sabe de que va el tema, y eso es casi lo que mas valoro.
Enfin, para gustos colores.