Hay algo mal en tu proyecto porque esto:
Código PHP:
Ver original$autoloader = new Zend_Loader_Autoloader_Resource
(array( 'namespace' => '',
'basePath' => APPLICATION_PATH,
'resourceTypes' => array( 'path' => 'models',
'namespace' => 'Model',
),
)
));
es lo que hace el Bootstrap cuando lo instancias, si te fijas dejaste el namespace en blanco como te comente y debería ser lo mismo que dejarlo en blanco en el application.ini
Y los Bootstrap's se ejecutan todos independientemente si entras al modulo o no, te funciona correctamente la navegación entre modulos ?