Administración archivos Dreamweaver

[sanxuan]

No creo que haya una manera mejor que otra de organizar las páginas. Cada persona encuentra ventajas en un sistema que para otro sin embargo pueden ser problemas.
Lo importante es la organización, que estén ordenadas, como parece que ya haces.
El que las imágenes estén en la raiz del sitio o en la carpeta del archivo que las usa no cambia el comportamiento. Lo importante es no confundirse en los enlaces y que haya cierta lógica en los nombres delos archivos y las carpetas para encontrarlos facilmente si los queremos modificar.

Si creas un enlace a tu carpeta raiz www.misitio.com el navegador intentará abrir siempre en primer lugar un archivo index.html en la carpeta raiz.
Lo mismo ocurrirá si creas un enlace a www.misitio.com/subcarpeta, se intenta abrir www.misitio.com/subcarpeta/index.html.

Supongo que es lo que preguntabas.