Primero hola a tod@s.
 
Bueno, parece que he encontrado la solución, pero no sé cómo ajustarla correctamente a mi función.
Yo por ejemplo quiero que sólo se pueda elegir una fecha a partir de hoy. Para eso calcula la fecha actual con php y le doy formato   
Código PHP:
Ver original- $fecha_actual = date("Y-m-d");  
-     $factual = $anio.$mes.$dia; 
Y $factual lo meto en un input hidden para luego recogerlo desde la función que me carga el calendario   
Código Javascript
:
Ver original- function cargaCalendarVolante() 
- { 
- var fechamin = document.getElementById('dateact'); 
-       Calendar.setup({ 
-           trigger    : "calconfirmaini", 
-           inputField : "finivolante", 
-           dateFormat: "%d/%m/%Y", 
-           cont: "calconfirmaini", 
-             min: fechamin, 
-           onSelect: function(cal)  
-           { 
-             var o = document.getElementById(this.args.inputField); 
-             var d = document.getElementById('ffinvolante'); 
-             d.value = o.value; 
-             this.hide() 
-           } 
-       }); 
-      
- }; 
He comprobado que la fecha llega correctamente pero luego no coge la variable y puedo seleccionar la que yo quiera. Además el this.hide sólo me funciona si selecciono una fecha, no cuando pincho en cualquier lado de la pantalla como antes. 
Gracias de nuevo!!