buenas...
la ruta real no se puede tomar mediante javascript aunque estes haciendo la prueba mediante un servidor HTTP local. o sea, no es lo mismo operar por el protocolo file:/// que por http:// tampoco javascript puede interactuar con el servidor para obtener la ruta. no se si con alguna directiva de apache puedas obtener dicha informacion, eso tendrias que preguntarlo en el foro de servidores. para obtener esa ruta real necesitarias de un lenguaje de lado servidor como php, jsp o cualquier otro.