Muchas gracias a todos por la data y efectivamente había leído también en Web Hosting Talk que varios recomendaban el servicio de
http://www.bqbackup.com/.
Por cierto, por si a alguien le sirve encontré un muy buen tutorial en español sobre el uso de la herramienta rsync,
http://www.vicente-navarro.com/blog/...ups-con-rsync/.
Asimismo me parece excelente la opción de datacenter de una vez por semana una imagen del VPS y a diario backup incrementales de las carpetas y archivos de los usuarios.
Con respecto a hacer backups incrementales de los archivos y carpetas con rsync ya lo entendí, ahora mi pregunta es, las imágenes del VPS ¿con qué herramienta de la línea de comandos las hago?. Y por lo que leí las imágenes no se pueden hacer incrementales, es decir una vez por semana haría una imagen del VPS completa y ¿estaría obligado a transferirla completa a los servers de bqbackup?.