Alternativas a getElementById y document.write

[sirguy]

Buenos días, de nuevo aquí con una duda. He mirado por las FAQ y no he encontrado nada similar.
Por motivos de servidor me veo obligado a hacer un buscador en javascript, busco los datos en una array y devuelvo el resultado. Paso los parámetros por la url a una ventana tipo lightbox (slimbox, una variante que permite cargar html dentro) y me carga el resultado.
La búsqueda me genera las líneas con los enlaces y ahí está el problema. Si cargo los datos con document.write me come todo el html y solo devuelve los datos de la búsqueda por lo que no carga en el slimbox.
Si devuelvo los datos con document.getElementById('xxxx').innerHTML no me hace caso del atributo rel y por lo tanto no me hace el efecto deseado y me carga la página en _blank en lugar de usar el slimbox.
¿A alguien le ha pasado esto?. En caso afirmativo, ¿existe solución?.

Muchas gracias