Expresion regular :S

[goteen_mx]

El problema es que se repite tu fin de cadena, por lo que esta adentro lo tomoa desde el primer toquen hasta la mitada de cadena y la segunda desde el primero hasta el fin de cadena, puedes agregarle la opción g para que busque todas las coincidencias desde el principio y modificar tu cadena del final

var str = "<!--:es-->Texto numero 1<!--:--><!--:es-->texto numero 2<!--:fes-->";

var patt1 = /(<!--:es-->)([A-z]| )*[0-9]<!--:-->/gi;
document.write(str.match(patt1));


document.write("<br><br>");
var patt1 = /<!--:es-->(.|\n)*?<!--:-->/ig;
document.write(str.match(patt1));

Saludos.