Como comenta daniel actualmente hay una gran diferencia en cuestiones de optimizacion para buscadores entre por ejemplo un sitio diseñado con flash y otro con html.
Te recomiendo tambien no utilizar flash si tu objetivo es subir posiciones mas facilmente, ahora si es tu eleccion tambien puedes mejorar algunas cosas para facilitar el trabajo a los buscadores, te recomiendo el
Centro SEO de Adobe Flash (
en ingles)
Saludos
