¿Nero 5.1? Es bastante antiguo, no obstante no es motivo.
Lo que no puedes hacer es coger directamente el archivo y que te lo convierta el Nero, casi siempre lo hace mal.
El crear un VCD lleva una serie de pasos previos, hay que convertir el archivo a .mpg de unas características determinadas (352x288, 25 fps, etc)
Si el audio se desincroniza es posible que sea pq el archivo original no estaba en 25fps, y como el VCD PAL sí lo está, por ello se produce desincronización.
Ah, si la liga a que te refieres es mi página, ahora está offline, pásate mañana que estará recuperada. Hay dos manuales para crear VCD, en mi opinión es mucho mejor hacerlos con Canopus Procoder (no da tantos fallos como el famoso tmpgenc).
Un saludo