Hola:
Si son varios checks y tienen que llevar el mismo nombre, lo que tienes es un array y como tal debe indexarse. Los id's no pueden duplicarse, pero los atributos name sí, así que desde javascript puedes acceder por sus respectivos índices:
document.forms.el_form["check[]"][0]
...
document.forms.el_form["check[]"][i]
Saludos
