Amigo el primer problema que tienes es almacenar esos archivos tan grandes en una base de datos, lo que te recomiendo es que mejor subas el archivo a una ruta en tu servidor y guardes esa ruta en la base de datos.
Lo otro es leer el archivo de excel, no importa que color o que tema tenga la celda igual el contenido sigue siendo texto te recomiendo que utilices una libreria de PHP que se llama PHP-ExcelReader y
aqui podras encontrar mas informacion de como utilizarla.
Espero que te sirva de algo.