no debes preocuparte, internamente php hace los cambios de rutas...
bueno, si de plano haces un
include tipo
c:/ruta/script.php pues si estas muy mal, pero mientras uses rutas relativas tipo
./ruta/script.php o
../ruta/script.php no deberías tener ningún problema...
otra técnica es usar
dirname(__FILE__) para definir alguna constante que nos especifica la ruta del índice, dicho así, usar siempre esta constante para ubicar bien los otros scripts...
también podrías usar $_SERVER['
DOCUMENT_ROOT'] que es el equivalente a
./ (
la raíz del sitio)