El href se recomienda usarlo para que el navegador lo reconozca como enlace (los onclick no los reconoce como enlace). Así gracias al href el navegador pone el cursor en la manita.
Podrías ponerlo sólo así
<a href="#" onClick="window.open('nombre_pagina.asp?rut=<%=req uest("rut_cliente")%>','ventana','width=400,height =400'); return false"><%=request("rut_cliente")%></a>
Te funcionaría igual.
Lo único es que de la otra forma, al pasar el raton sobre el link mostraría en la barra de status a dónde llevará el enlace. En cambio si le dejas sólo el # no se verá a dónde lleva.
Por cierto que a la ventana popup le dí unas medidas de 400x400, cambialas a lo que quieras
