En mi opinion, lo correcto seria:
1-Llamada ajax al servidor.
2-Servidor responde con un JSON:
{area1:'<p>aqui area 1</p>',area2:'<b>hola</b>'}
3-Javascript interpeta el JSON y :
document.getElementById('area1').innerHTML = json.area1;
document.getElementById('area2').innerHTML = json.area2;
php cuenta con una funcion json_encode(), la cual convierte un objeto o array en un string json valido. no se si JSP tiene algo asi.
espero que te sirva.saludos.