Por ejemplo declaras tu url base
Código PHP:
define("BASE_URL", "miurl.com");
también puedes hacerlo con la carpeta de js, css
define("JS_FOLDER", "/js");
define("CSS_FOLDER", "/css");
Luego haces esto en tu función
Código PHP:
echo "<script language='javascript' src='".BASE_URL.JS_FOLDER."/jquery1.js'></script>";