Hola de nuevo!!
Bueno encontré la solución gracias a la función"array_key_exists"
Código PHP:
foreach ($bd_locus as $bd_acc_name => $bd_tab_locus)
{
foreach ($bd_tab_locus as $bd_locus_name => $bd_tab_allele)
{
//aca veo que si $bd_locus_name existe en $file_locus
//sabiendo que $bd_locus_name =$locus_name
//o sea, me sirvo de la variable en comun existente en las dos tablas
if (array_key_exists($bd_locus_name,$file_locus))
{
echo "<br>".$bd_locus_name."----allele 1 bd = ".$bd_tab_allele['allele_1_bd']."----allele 2 bd =".$bd_tab_allele['allele_2_bd']."<br> Locus file = ".$bd_locus_name."----allele 1 file = ".$file_locus[$bd_locus_name]['allele_1']."----allele 2 file =".$file_locus[$bd_locus_name]['allele_2']."<br><br>";
}
else
{
echo "<br><br>$bd_locus_name pas defini dans fichier exel";
}
}
}
Vega_012 muchas gracias por tu respuesta, la voy a probar de todas maneras, puede ser otra alternativa.
Adios