Hola, ya he encontrado la solucion, la pongo por si a alguien lo necesita:
Código HTML:
//Conexion a la base de datos para añadir ficheros a joomdoc
$j = new JConfig();
$dbh = mysql_connect($j->host, $j->user, $j->password) or die('error db');
$sql = "INSERT INTO `#__joomdoc` (catid, dmowner, published, approved, dmsubmitedby) VALUES (17, 64, 1, 1, 62)";
$db = mysql_select_db($j->db, $dbh) or die('error db');
mysql_query($query);
mysql_close($dbh);
WebMaster, puedes dar el tema como solucionado!