a ver, si el contenido que muestras es tal cual entonces no son arrays...
es texto, resultado de la función
print_r() lo que se puede observar...
si los archivos contuvieran realmente código PHP, y dentro de ellos se define un arreglo, sería sencillo cargar dichos arreglos en variables y procesarlos de forma amistosa... (:
pero si el formato es crudo, tal cual lo muestras es realmente nada fácil procesarlo todo con lógica, ya que debes tener unos buenos conocimientos del lenguaje, funciones de cadenas, expresiones regulares, etc...
y te voy a ser honesto, si tienes experiencia con todo lo que mencione antes no debes costar ningún problema resolver el primero problema...