el tema es que esos archivos debes subirlos a un servidor para que los usuarios puedan visualizarlos y/o descargarlos.
Por ende vas a tener que subir todo, asi que ya que tenes que hacer eso ponelos todos dentro del mismo directorio y listo.
tu estructura de sitio deberia ser algo asi (no lo tomes tal cual)
Cita: tu sitio
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|_imagenes
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|_css
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|_descargas
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|_index.html
se entiende?