El código PHP es correctísimo (aunque no cerró con ?>, pero será un error de tipeo), pero está mal usado. Tal que así, eso queda:
Código Javascript
:
Ver originalif((navigator.appName == "explorer")&&(screen.width>==1024) )
<link rel=\"stylesheet\" href=\"$GLOBALS[mosConfig_live_site]/templates/$GLOBALS[cur_template]/css/ie.css\"
Sustituyendo $GLOBALS[...] por su valor correspondiente. Por tanto el código no tiene sentido.