Buenas, he estado mirando y yo no pondría la siguiente linea:
<div class="latest<?php if(!$this->countModules('user1') and JRequest::getCmd('layout') != 'form') : ?> only<?php endif; ?>">
Quiero decir sustituyes lo que tenias por los dos div sin las lineas:
<div class="latest<?php if(!$this->countModules('user1') and JRequest::getCmd('layout') != 'form') : ?> only<?php endif; ?>">
No se si me he explicado muy bien pero ...