No parece una estructura muy práctica pero tu sabras....
Se me ocurre lo siguiente, siempre que tengas acceso a la base
INFORMATION_SCHEMA
con esto obtienes los nombres de las tablas a modificar, luego con algun lenguaje de programació externo puedes hacer un bucle que vaya construyendo y ejecutando las sentencias
ALTER TABLE... para cada una.
Quim
Nota: lo normal es tener una tabla usuarios que incluya el id y nombre del usuario en uno de sus campos con lo que con una sola tabla pasas...